EkoConnect hat sich für seine Arbeit insbesondere folgende Ziele gesetzt:

• die Akteure und Aktivitäten zur nachhaltigen Entwicklung des ökologischen Landbaus in Mittel- und Osteuropas unterstützen und vernetzen,
• die Entwicklung des ländlichen Raums stärken,
• die Verfügbarkeit von ökologisch erzeugten Produkten und Lebensmitteln fördern,
• die Zusammenarbeit innerhalb der und zwischen den Staaten Mittel- und Osteuropas und mit Westeuropa forcieren und
• eine Plattform für die Begegnung der beteiligten Akteure aus ganz Europa schaffen.